De diagnostiek naar een coronavirus (CoV) infectie berust op het direct aantonen van coronavirus in respiratoir materiaal met behulp van PCR. De standaard bepaling hiervoor is de multiplex PCR-bepaling voor respiratoire verwekkers, die typeert op coronavirus SARS-CoV-2, 229E, OC43, HKU-1 en NL63.
Voor specifieke diagnostiek op het SARS-2 coronavirus zie de verrichting SARS-CoV-2 PCR.
Voor specifieke diagnostiek op het MERS-coronavirus zie de verrichting MERS-CoV PCR. Bij verdenking MERS dient altijd contact opgenomen te worden met de arts-microbioloog virologie. Zie Zenya voor de diverse MERS protocollen.