Mycoplasma genitalium is een bacterie zonder celwand en is daardoor moeilijk aan te tonen door middel van kweek. De bacterie wordt voornamelijk aangetoond in het urogenitale gebied, hoewel het soms ook in keel en rectum te vinden is. M. genitalium infectie is een nog relatief onbekende SOA, onder andere omdat infecties met deze verwekker deels asymptomatisch kunnen verlopen. Diagnostiek naar M. genitalium lijkt aangewezen bij patiënten met een klinisch beeld van urethritis, cervicitis en/of PID, bij wie Chlamydia en gonorroe diagnostiek negatief is of bij wie klachten blijven bestaan na behandeling van een Chlamydia of gonorroe infectie.
De diagnostiek naar een Mycoplasma genitalium infectie berust op het direct aantonen van specifiek nucleïnezuur middels real-time PCR in urine, genitaal- of rectumuitstrijken. Deze PCR is onderdeel van de STI multiplex PCR die ook Chlamydia trachomatis (CT), Neisseria gonorrhoeae (GO) en Trichomonas vaginalis (TV) detecteert.
Mycoplasma genitalium blijkt in toenemende mate resistent tegen het macrolide antibioticum azitromycine. Om dit te bepalen, kan de macrolide resistentie PCR uitgevoerd worden.